Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PLS1Q14651 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PLS1Q14651 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PLS1Q14651 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.3 ms