Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMAD4Q13485 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMAD4Q13485 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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