Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MRPL49Q13405 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MRPL49Q13405 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MRPL49Q13405 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms