Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SP140Q13342 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SP140Q13342 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SP140Q13342 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SP140Q13342 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SP140Q13342 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SP140Q13342 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SP140Q13342 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SP140Q13342 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SP140Q13342 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SP140Q13342 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SP140Q13342 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SP140Q13342 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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