Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NR5A1Q13285 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR5A1Q13285 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR5A1Q13285 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms