Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATRXP46100 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
ATRXP46100 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ATRXP46100 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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