Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRTM2O43300 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRTM2O43300 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRTM2O43300 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRRTM2O43300 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRRTM2O43300 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRRTM2O43300 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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