Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
CCDC47Q96A33 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CCDC47Q96A33 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CCDC47Q96A33 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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