Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GEN1Q17RS7 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GEN1Q17RS7 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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GEN1Q17RS7 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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GEN1Q17RS7 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GEN1Q17RS7 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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