Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RTN1Q16799 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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