Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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VPS72Q15906 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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VPS72Q15906 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
VPS72Q15906 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
VPS72Q15906 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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