Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COL9A3Q14050 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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COL9A3Q14050 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
COL9A3Q14050 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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