Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1CQ13936 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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