Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CUL1Q13616 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CUL1Q13616 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CUL1Q13616 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms