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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
AC107958.3-201
ENST00000553410
431 nt
TSL 3
BASIC
-0.37
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR34C-201
ENST00000384831
77 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU7-197P-201
ENST00000458836
62 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU7-106P-201
ENST00000459514
67 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU6-850P-201
ENST00000516934
103 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AL670379.3-201
ENST00000605040
251 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AC084368.1-201
ENST00000620935
65 nt
BASIC
-0.38
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AC108866.1-201
ENST00000503073
2339 nt
TSL 5
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
Y_RNA.297-201
ENST00000364950
91 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
Y_RNA.489-201
ENST00000384410
101 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR617-201
ENST00000385030
97 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU7-120P-201
ENST00000459334
63 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR3121-201
ENST00000579680
77 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR3666-201
ENST00000607845
111 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AC069503.3-201
ENST00000618674
145 nt
BASIC
-0.39
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
SNORD38.2-201
ENST00000384470
69 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
RNU6-320P-201
ENST00000516511
106 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR548AG2-201
ENST00000581228
64 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR3163-201
ENST00000581592
73 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
AC141273.2-201
ENST00000618989
130 nt
BASIC
-0.4
□□□□□ -2.47
CUL1
Q13616
MIR519E-201
ENST00000385075
84 nt
BASIC
-0.41
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
CYP19A1-220
ENST00000613097
123 nt
TSL 5
BASIC
-0.41
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.401-201
ENST00000383965
117 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.466-201
ENST00000384294
113 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-463P-201
ENST00000384340
107 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR516B1-201
ENST00000385211
90 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MT-TI-201
ENST00000387365
69 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
IGKV1-22-201
ENST00000524313
326 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
AC040936.1-201
ENST00000534543
172 nt
TSL 5
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-1201P-201
ENST00000384227
107 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR106A-201
ENST00000384870
81 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.700-201
ENST00000516806
100 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU7-6P-201
ENST00000516845
62 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR4719-201
ENST00000585233
84 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.773-201
ENST00000607168
90 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNA5SP275-201
ENST00000363936
118 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.198-201
ENST00000364013
98 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.280-201
ENST00000364765
112 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
SNORD49B-201
ENST00000365172
72 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU4-11P-201
ENST00000365287
132 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR516A2-201
ENST00000384888
90 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR516A1-201
ENST00000385033
90 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNA5SP300-201
ENST00000391197
107 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
AC096531.1-201
ENST00000419107
107 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-200P-201
ENST00000364743
107 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR7-2-201
ENST00000384970
110 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNA5SP136-201
ENST00000410906
107 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.662-201
ENST00000516028
97 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-1006P-201
ENST00000516998
103 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
NFIA-AS1-206
ENST00000630199
220 nt
TSL 5
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR655-201
ENST00000362159
97 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.213-201
ENST00000364178
111 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-915P-201
ENST00000364943
103 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.580-201
ENST00000391004
95 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-1254P-201
ENST00000391266
104 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR2113-201
ENST00000459007
91 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-861P-201
ENST00000516745
106 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RN7SL660P-201
ENST00000614852
299 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
AP001340.1-201
ENST00000624405
217 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-1313P-201
ENST00000362622
102 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-647P-201
ENST00000364243
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-811P-201
ENST00000384069
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MT-TG-201
ENST00000387429
68 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
RNU6ATAC11P-201
ENST00000408541
125 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
AC244250.2-201
ENST00000418731
148 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
MTRNR2L2-201
ENST00000604882
87 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
Y_RNA.778-201
ENST00000620203
90 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
CUL1
Q13616
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.144-201
ENST00000363521
113 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-1163P-201
ENST00000364516
107 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR329-2-201
ENST00000385029
84 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RN7SKP19-201
ENST00000516016
252 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR6507-201
ENST00000613630
70 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
uc_338.10-201
ENST00000621872
182 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR1255B1-201
ENST00000636325
63 nt
BASIC
-0.48
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNA5SP257-201
ENST00000363023
116 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.114-201
ENST00000363265
113 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.785-201
ENST00000384290
109 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MT-TY-201
ENST00000387409
66 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-460P-201
ENST00000391158
108 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
SNORD126-201
ENST00000459475
77 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU5E-3P-201
ENST00000515913
68 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-1018P-201
ENST00000516577
106 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
MIR4263-201
ENST00000584745
83 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
AL162726.3-218
ENST00000636401
95 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
SNORD14C-201
ENST00000365382
88 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-138P-201
ENST00000515952
107 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
RNU6-287P-201
ENST00000516230
98 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
CUL1
Q13616
Y_RNA.696-201
ENST00000516725
107 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
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