Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNX1Q13596 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNX1Q13596 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNX1Q13596 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms