Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
RIPK1Q13546 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
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RIPK1Q13546 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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RIPK1Q13546 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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RIPK1Q13546 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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RIPK1Q13546 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
RIPK1Q13546 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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