Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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TCIRG1Q13488 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TCIRG1Q13488 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TCIRG1Q13488 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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