Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SF3B2Q13435 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SF3B2Q13435 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SF3B2Q13435 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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