Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
XRCC4Q13426 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
XRCC4Q13426 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
XRCC4Q13426 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
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