Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RESTQ13127 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RESTQ13127 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RESTQ13127 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
RESTQ13127 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
RESTQ13127 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RESTQ13127 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RESTQ13127 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RESTQ13127 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RESTQ13127 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms