Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CPSF1Q10570 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CPSF1Q10570 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.79□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
CPSF1Q10570 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.86
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