Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CENPFP49454 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CENPFP49454 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CENPFP49454 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CENPFP49454 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CENPFP49454 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CENPFP49454 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CENPFP49454 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CENPFP49454 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
CENPFP49454 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
CENPFP49454 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CENPFP49454 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CENPFP49454 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CENPFP49454 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CENPFP49454 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CENPFP49454 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CENPFP49454 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
CENPFP49454 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
CENPFP49454 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CENPFP49454 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CENPFP49454 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-4.24□□□□□ -3.09
CENPFP49454 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CENPFP49454 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CENPFP49454 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CENPFP49454 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CENPFP49454 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CENPFP49454 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CENPFP49454 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CENPFP49454 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CENPFP49454 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CENPFP49454 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CENPFP49454 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CENPFP49454 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CENPFP49454 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CENPFP49454 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CENPFP49454 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
CENPFP49454 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-4.32□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.3 ms