Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXD10P28358 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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HOXD10P28358 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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HOXD10P28358 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD10P28358 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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HOXD10P28358 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD10P28358 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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