Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	AC096720.1-201	ENST00000604441	183 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.3
TAF1	P21675	FAM13A-AS1_1.1-201	ENST00000612555	119 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.3
TAF1	P21675	MIR3914-2-201	ENST00000637339	95 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.3
TAF1	P21675	RNU4-45P-201	ENST00000365469	141 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	SNORA32-201	ENST00000384072	121 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	MIR92A1-201	ENST00000385233	78 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	TRAJ51-201	ENST00000504127	63 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-789P-201	ENST00000517105	102 nt	BASIC	0.65	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	ZBTB41-201	ENST00000367405	8478 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	SNORA36.2-201	ENST00000384004	127 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	SNORA72.6-201	ENST00000384520	129 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU4-83P-201	ENST00000410863	133 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	MIR548H5-201	ENST00000580314	60 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-90P-201	ENST00000606352	106 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU7-10P-201	ENST00000607194	63 nt	BASIC	0.64	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNA5SP222-201	ENST00000411039	105 nt	BASIC	0.63	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	CEP290-203	ENST00000547691	5968 nt	TSL 1 (best) BASIC	0.63	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AP001362.1-201	ENST00000625165	124 nt	BASIC	0.63	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	Y_RNA.13-201	ENST00000362403	112 nt	BASIC	0.62	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU4-36P-201	ENST00000364294	144 nt	BASIC	0.62	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AL158147.1-201	ENST00000443970	75 nt	BASIC	0.62	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AC018659.1-201	ENST00000551083	169 nt	BASIC	0.62	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	TEX15-201	ENST00000256246	10110 nt	TSL 1 (best) BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AL162376.1-201	ENST00000624117	175 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-1313P-201	ENST00000362622	102 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	Y_RNA.119-201	ENST00000363301	96 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-509P-201	ENST00000363519	107 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	Y_RNA.712-201	ENST00000517011	92 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AC244669.1-204	ENST00000621564	178 nt	BASIC	0.61	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-616P-201	ENST00000384353	107 nt	BASIC	0.6	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	Y_RNA.433-201	ENST00000384089	102 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	Y_RNA.549-201	ENST00000384657	102 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	MIR516A2-201	ENST00000384888	90 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	MIR516A1-201	ENST00000385033	90 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AC023932.2-201	ENST00000603176	175 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	AC092634.7-201	ENST00000621022	103 nt	BASIC	0.59	□□□□□ -2.31
TAF1	P21675	RNU6-1163P-201	ENST00000364516	107 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-726P-201	ENST00000364680	107 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD113-1-201	ENST00000365321	69 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR5009-201	ENST00000578736	100 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR548AI-201	ENST00000579940	88 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR4639-201	ENST00000584938	69 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	AC067863.3-201	ENST00000624172	122 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.56-201	ENST00000362798	112 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD36A-201	ENST00000362874	73 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.273-201	ENST00000364703	102 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-1056P-201	ENST00000383996	107 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR140-201	ENST00000385282	100 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-479P-201	ENST00000516348	105 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	U6.95-201	ENST00000636931	70 nt	BASIC	0.58	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR6755-201	ENST00000619993	66 nt	BASIC	0.57	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD45B-201	ENST00000364617	72 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	AC114737.2-201	ENST00000421583	173 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-1006P-201	ENST00000516998	103 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR3612-201	ENST00000579753	87 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD38.1-201	ENST00000363863	68 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNA5SP63-201	ENST00000391225	112 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.709-201	ENST00000516952	92 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	AC068339.1-201	ENST00000526965	141 nt	BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	LMBR1-222	ENST00000638959	93 nt	TSL 5 BASIC	0.56	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.342-201	ENST00000365352	113 nt	BASIC	0.55	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-571P-201	ENST00000384128	107 nt	BASIC	0.55	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD20-201	ENST00000384550	80 nt	BASIC	0.55	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.601-201	ENST00000410500	113 nt	BASIC	0.55	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	AL365222.1-201	ENST00000614661	98 nt	BASIC	0.55	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORA9.1-201	ENST00000362412	131 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD116-21-201	ENST00000384507	92 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-476P-201	ENST00000384726	107 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-679P-201	ENST00000391003	106 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	ATP6V0E1P1-201	ENST00000412537	226 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	COX7A2-206	ENST00000472311	325 nt	TSL 2 BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORA62.5-201	ENST00000516634	120 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU7-161P-201	ENST00000517289	62 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	hsa-mir-3130-1.1-201	ENST00000579223	75 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	MIR3613-201	ENST00000579844	87 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	SNORD28-201	ENST00000384706	75 nt	BASIC	0.54	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	Y_RNA.57-201	ENST00000362806	113 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-816P-201	ENST00000390914	107 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-243P-201	ENST00000391140	107 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-1268P-201	ENST00000391214	107 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	RNU6-1239P-201	ENST00000391310	107 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	AC097635.1-201	ENST00000450678	155 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	U2.22-201	ENST00000636441	106 nt	BASIC	0.53	□□□□□ -2.32
TAF1	P21675	KIF20B-201	ENST00000260753	6306 nt	APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-834P-201	ENST00000362367	110 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.98-201	ENST00000363109	102 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1201P-201	ENST00000384227	107 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1254P-201	ENST00000391266	104 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-589P-201	ENST00000516485	107 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	NEAT1_2.1-201	ENST00000620525	105 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.10-201	ENST00000362371	110 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-1260P-201	ENST00000362944	107 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-863P-201	ENST00000515989	104 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR3678-201	ENST00000578455	94 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	AC073869.9-201	ENST00000641610	120 nt	BASIC	0.52	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	Y_RNA.567-201	ENST00000384736	106 nt	BASIC	0.51	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	MIR548L-201	ENST00000408303	86 nt	BASIC	0.51	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNU6-850P-201	ENST00000516934	103 nt	BASIC	0.51	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	SAMD9-203	ENST00000620985	6754 nt	APPRIS P1 TSL 2 BASIC	0.5	□□□□□ -2.33
TAF1	P21675	RNY3P2-201	ENST00000362918	102 nt	BASIC	0.5	□□□□□ -2.33

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