Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
APOC4-APOC2K7ER74 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
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