Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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