Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
YIPF1Q9Y548 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
YIPF1Q9Y548 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
YIPF1Q9Y548 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
YIPF1Q9Y548 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
YIPF1Q9Y548 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.6 ms