Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SP6Q3SY56 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms