Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SF1Q15637 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SF1Q15637 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SF1Q15637 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SF1Q15637 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SF1Q15637 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SF1Q15637 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SF1Q15637 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SF1Q15637 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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