Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIV2LQ15477 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIV2LQ15477 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SKIV2LQ15477 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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