Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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SEC23AQ15436 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SEC23AQ15436 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SEC23AQ15436 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SEC23AQ15436 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23AQ15436 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SEC23AQ15436 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SEC23AQ15436 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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