Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
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NR1I3Q14994 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NR1I3Q14994 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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NR1I3Q14994 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1I3Q14994 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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