Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPNMBQ14956 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GPNMBQ14956 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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GPNMBQ14956 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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GPNMBQ14956 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GPNMBQ14956 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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