Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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CHD4Q14839 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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CHD4Q14839 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CHD4Q14839 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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CHD4Q14839 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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CHD4Q14839 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
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CHD4Q14839 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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