Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
TCOF1Q13428 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TCOF1Q13428 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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