Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLN3Q13286 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CLN3Q13286 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLN3Q13286 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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