Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTGDRQ13258 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTGDRQ13258 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205 ms