Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRMP28827 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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PTPRMP28827 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPRMP28827 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRMP28827 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
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