Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLDN4O14493 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
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CLDN4O14493 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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CLDN4O14493 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CLDN4O14493 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CLDN4O14493 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLDN4O14493 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CLDN4O14493 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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CLDN4O14493 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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