Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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RRN3Q9NYV6 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RRN3Q9NYV6 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RRN3Q9NYV6 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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