Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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PRPF18Q99633 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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