Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FAM3DQ96BQ1 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FAM3DQ96BQ1 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms