Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRIM63Q969Q1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TRIM63Q969Q1 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRIM63Q969Q1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms