Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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USP49Q70CQ1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USP49Q70CQ1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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USP49Q70CQ1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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USP49Q70CQ1 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP49Q70CQ1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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