Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SP6Q3SY56 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SP6Q3SY56 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SP6Q3SY56 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms