Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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RTL8BQ17RB0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
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