Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SNAPC1Q16533 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNAPC1Q16533 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNAPC1Q16533 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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