Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SYCP1Q15431 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SYCP1Q15431 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SYCP1Q15431 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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