Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
BRD3Q15059 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
BRD3Q15059 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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BRD3Q15059 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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BRD3Q15059 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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BRD3Q15059 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BRD3Q15059 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BRD3Q15059 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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