Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNX17Q15036 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX17Q15036 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX17Q15036 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SNX17Q15036 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SNX17Q15036 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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SNX17Q15036 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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SNX17Q15036 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SNX17Q15036 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SNX17Q15036 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX17Q15036 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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